146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0144 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  86.25 
 
 		 380 aa  634    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  84.47 
 
 		 389 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  83.91 
 
 		 388 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  83.68 
 
 		 389 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  82.42 
 
 		 372 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  82.42 
 
 		 372 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  82.14 
 
 		 372 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  81.97 
 
 		 374 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  64.66 
 
 		 354 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  29.32 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  27.3 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  26.8 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  32.29 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  28.51 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  28.51 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  30 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  29.84 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  29.8 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  29.8 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  25.88 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  29.1 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  31.12 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  28.85 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  28.85 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  30.64 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  27.66 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  30.1 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  30.1 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  30.1 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  29.95 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  29.95 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  29.95 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  29.95 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  31.84 
 
 		 226 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  28.77 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  30.43 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  28.05 
 
 		 356 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  28.05 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  28.05 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  29.12 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  29.3 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  27.57 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  31.77 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  27.14 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  32.93 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  32.32 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  25.25 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  25.25 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.95 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  28.98 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25.28 
 
 		 679 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  25.53 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.28 
 
 		 679 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  25.28 
 
 		 679 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.28 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.19 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28.02 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  24.91 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  33.58 
 
 		 635 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.1 
 
 		 733 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.94 
 
 		 746 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  30.72 
 
 		 725 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  30.72 
 
 		 725 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  30.72 
 
 		 725 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.75 
 
 		 725 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  25.4 
 
 		 681 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  31.58 
 
 		 700 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.1 
 
 		 700 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  30.46 
 
 		 718 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.01 
 
 		 679 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.4 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  25.17 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.54 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 		 734 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  25.14 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 		 734 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.6 
 
 		 741 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  29.34 
 
 		 664 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  29.76 
 
 		 734 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.93 
 
 		 724 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.44 
 
 		 679 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  21.58 
 
 		 698 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  26.04 
 
 		 730 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  29.81 
 
 		 733 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  24.85 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.66 
 
 		 734 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  28.32 
 
 		 728 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.2 
 
 		 717 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>