65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0326 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  97.39 
 
 
345 aa  688    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  26.4 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  29.82 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  29.82 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  29.82 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  29.82 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  29.39 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  29.39 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  29.39 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  24.36 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.72 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  27.32 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  26.26 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  26.26 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  32 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  25.76 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  29.08 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  29.08 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  26.48 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  28.57 
 
 
352 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  25.25 
 
 
371 aa  62.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  28.57 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  29.8 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  26.29 
 
 
380 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  26.29 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  26.29 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  26.29 
 
 
388 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  28.1 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  30.28 
 
 
374 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  26.67 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  28.17 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  25.97 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  22.75 
 
 
702 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  25.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  26.28 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  26.28 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  24.05 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  26.88 
 
 
625 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  25.85 
 
 
677 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.47 
 
 
697 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  26.53 
 
 
679 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.5 
 
 
692 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.53 
 
 
679 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  26.53 
 
 
679 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  22.92 
 
 
444 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.53 
 
 
679 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  27.56 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  26.53 
 
 
679 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  25.71 
 
 
682 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  21.53 
 
 
699 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.63 
 
 
697 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  23.04 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  24.05 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  27.03 
 
 
670 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  22.31 
 
 
695 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  26.4 
 
 
659 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>