167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0154 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  760    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  93.05 
 
 		 372 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  93.05 
 
 		 372 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  93.32 
 
 		 372 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  81.84 
 
 		 380 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  80.11 
 
 		 388 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  81.05 
 
 		 389 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  80.21 
 
 		 389 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  80.6 
 
 		 371 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  64.56 
 
 		 354 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  28.84 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  29.39 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  29.39 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  29.39 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  29.39 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  29.39 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  29.33 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  27.84 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  31.07 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  28.45 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  31.07 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  27.35 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  31.07 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  31.07 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  30.92 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  31.07 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  30.92 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  29.92 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  29.92 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  29.15 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  29.73 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  31.63 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  32.39 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  27.04 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  32.4 
 
 		 226 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  25.77 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  25.77 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  26.96 
 
 		 362 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  29.51 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  28.07 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  28.07 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  28.07 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  31.21 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  30.05 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  24.39 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  25.21 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  28.66 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  25.6 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  35.37 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  34.15 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  25.76 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  26.42 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.12 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  27.84 
 
 		 681 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  25.52 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  23.46 
 
 		 733 aa  59.7  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  24.44 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  31.01 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  31.01 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  29.03 
 
 		 690 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  31.01 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.07 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  24.45 
 
 		 638 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  31.01 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  31.82 
 
 		 700 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  24.44 
 
 		 679 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.44 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  24.44 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.13 
 
 		 699 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  25.13 
 
 		 700 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  24.65 
 
 		 638 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.49 
 
 		 690 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  26.61 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  30.34 
 
 		 718 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.72 
 
 		 700 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  21.71 
 
 		 698 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  28.49 
 
 		 711 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  24.55 
 
 		 679 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  32.05 
 
 		 635 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.33 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  23.46 
 
 		 670 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 		 730 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.27 
 
 		 746 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.99 
 
 		 679 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  29.75 
 
 		 728 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  29.76 
 
 		 734 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  29.76 
 
 		 734 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  29.14 
 
 		 734 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.4 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>