66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0520 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  95.25 
 
 		 358 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  72.25 
 
 		 345 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  54.19 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  53.91 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  53.06 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  53.48 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  53.76 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  53.48 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  53.76 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  53.76 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  53.76 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  53.76 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  52.79 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  53.07 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  53.07 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  52.79 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  53.8 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  48.87 
 
 		 361 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  47.5 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  45.82 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  47.5 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  44.82 
 
 		 374 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  43.3 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  45.17 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  45.4 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  27.7 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  32.75 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  29.37 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  33.47 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  32.68 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  32.68 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  32.68 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  32.68 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  32.68 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  27.09 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  26.82 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  26.82 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  29.57 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  29.55 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  35.71 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  32.34 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  32.42 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  32.42 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  32.42 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  32.34 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  32.34 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  32.42 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  32.34 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  31.51 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  26.63 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  28.93 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  25.27 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  24.73 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  28.82 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  28.12 
 
 		 733 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.4 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.71 
 
 		 719 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  27.68 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  26.96 
 
 		 653 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  32.65 
 
 		 734 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>