67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4665 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  95.25 
 
 		 358 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  71.68 
 
 		 345 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  53.91 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  53.63 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  53.07 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  52.51 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  52.79 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  52.51 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  52.79 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  52.79 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  52.79 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  52.79 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  52.23 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  53.63 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  53.63 
 
 		 356 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  53.35 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  53.51 
 
 		 356 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  49.44 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  47.11 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  47.11 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  44.51 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  43.77 
 
 		 374 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  43.63 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  45.74 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  45.66 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  30.88 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  27.45 
 
 		 444 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  29.63 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  29.09 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  32.32 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  29.09 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  29.09 
 
 		 352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  29.09 
 
 		 352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  29.09 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  27.22 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  29.32 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  29.9 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  34.24 
 
 		 226 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  30.4 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  31.84 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  31.96 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  31.96 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  31.96 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  31.84 
 
 		 372 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  31.96 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  31.84 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  31.84 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  31.05 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  34.94 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  29.8 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  24.18 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  28.82 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.4 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.5 
 
 		 733 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.71 
 
 		 719 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  27.12 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2135  inner membrane protein  31.97 
 
 		 734 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0318465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  29.38 
 
 		 653 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  27.22 
 
 		 764 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>