89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2163 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  818    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  76.21 
 
 
411 aa  622  1e-177  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  59.04 
 
 
444 aa  501  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  30.75 
 
 
374 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  31.03 
 
 
374 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  30.56 
 
 
356 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  29.17 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  29.17 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  30.95 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  28.61 
 
 
357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  29.57 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  29.57 
 
 
356 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  29.37 
 
 
345 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  30.69 
 
 
358 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  30.11 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  29.07 
 
 
356 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  29.07 
 
 
356 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  29.07 
 
 
356 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  29.35 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  26.01 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  32.5 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  32.5 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  27.75 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  27.91 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  25.56 
 
 
355 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  26.74 
 
 
339 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  25.48 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  25 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  25.48 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  25.48 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  25 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  29.7 
 
 
372 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  29.7 
 
 
372 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  29.7 
 
 
372 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  27.95 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  24.3 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  24.3 
 
 
352 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.205497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  23.68 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  24.02 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  24.02 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  23.68 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  24.02 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  26.34 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  28.11 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  28.11 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  28.11 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  28.11 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  27.57 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  24.73 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  26.54 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  24.1 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  23.59 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  23.86 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.3 
 
 
719 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.17 
 
 
740 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.49 
 
 
730 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  25.35 
 
 
717 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.93 
 
 
700 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  25.35 
 
 
717 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
692 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  25.35 
 
 
720 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  31.93 
 
 
700 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.5 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  26.11 
 
 
717 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  26.11 
 
 
717 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  26.11 
 
 
717 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  26.11 
 
 
717 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  26.11 
 
 
717 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  30.2 
 
 
644 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.79 
 
 
653 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  27.67 
 
 
718 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  25.66 
 
 
758 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  25.66 
 
 
758 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  25.66 
 
 
758 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  25.66 
 
 
758 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  24.67 
 
 
883 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.26 
 
 
763 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>