87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1872 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  837    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  76.21 
 
 		 403 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  60.81 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  30.69 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  29.79 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  28.2 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  27.79 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  28.31 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  28.9 
 
 		 345 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  28.97 
 
 		 357 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  28.97 
 
 		 357 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  29.63 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  28.72 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  28.72 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  28.72 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  28.72 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  28.72 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  28.94 
 
 		 357 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  29.37 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  28.69 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  28.32 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  28.01 
 
 		 356 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  28.01 
 
 		 356 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  28.01 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  33.57 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  33.57 
 
 		 356 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  28.27 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  32.53 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  28.4 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  29.06 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  24.33 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  28.11 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  27.84 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  27.84 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  27.84 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  27.84 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  26.22 
 
 		 352 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  25.95 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  25.95 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  25.95 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  25.95 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  25.95 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  25.26 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  25.94 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  29.35 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  30.05 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  30.22 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  30.22 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  30.05 
 
 		 374 aa  87  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  29.12 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  28.65 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  28.65 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  28.65 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  28.65 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  31.36 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  25.81 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  25.27 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.41 
 
 		 746 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  23.3 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  28.83 
 
 		 712 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  28.57 
 
 		 721 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  28.22 
 
 		 712 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  28.22 
 
 		 712 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  25.7 
 
 		 717 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  25.7 
 
 		 717 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  25.7 
 
 		 717 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  25.7 
 
 		 717 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  25.7 
 
 		 717 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  25.35 
 
 		 720 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  24.65 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  24.65 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  24.65 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  24.65 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  24.65 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  24.65 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  24.65 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  23.78 
 
 		 720 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  28.77 
 
 		 731 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  25.14 
 
 		 720 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.5 
 
 		 719 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.37 
 
 		 700 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  30.13 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  28.57 
 
 		 700 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  25.68 
 
 		 711 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.28 
 
 		 670 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>