99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3209 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  721    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  61.25 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  61.25 
 
 		 352 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  61.25 
 
 		 352 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  60.97 
 
 		 352 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  60.97 
 
 		 352 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2576  putative inner membrane protein  61.36 
 
 		 352 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1649  conserved hypothetical protein  54.99 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1054  hypothetical protein  54.99 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1632  hypothetical protein  54.99 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2299  hypothetical protein  54.99 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2146  hypothetical protein  54.99 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  55.68 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01911  conserved inner membrane protein  55.68 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01897  hypothetical protein  55.68 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1227  hypothetical protein  63.59 
 
 		 226 aa  255  7e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  31.98 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  31.25 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  35.86 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  33.75 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  34.32 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  30.26 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  34.32 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  30.26 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  30.26 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  30.26 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  33.33 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  30.26 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4665  hypothetical protein  32.32 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5013  membrane protein  29.41 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  29.97 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  29.97 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0520  hypothetical protein  33.47 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2491  hypothetical protein  29 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326569  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  28.86 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5453  membrane protein  28.95 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.257808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1229  inner membrane protein YeeA  45.77 
 
 		 142 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.365839  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02986  hypothetical protein  34.75 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.538178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  28.65 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4650  membrane protein  27.22 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3713  membrane protein  27.22 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0373028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3808  membrane protein  27.64 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.27996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2398  membrane protein  30.12 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  25.35 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2106  hypothetical protein  28.34 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  29.33 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  29.33 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  29.33 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  29.33 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  27.05 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  27.05 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  27.05 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  27.05 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  26.57 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  25.95 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2200  membrane protein-like protein  22.38 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1872  hypothetical protein  24.33 
 
 		 411 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.949133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  27.08 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0309  hypothetical protein  29.8 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0326  hypothetical protein  29.8 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.27 
 
 		 719 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  23.65 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.24 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.75 
 
 		 699 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  24.74 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.13 
 
 		 763 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.72 
 
 		 763 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  46.55 
 
 		 725 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  29.94 
 
 		 733 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  26.92 
 
 		 700 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.6 
 
 		 763 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  32.61 
 
 		 724 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  26.6 
 
 		 763 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1226  hypothetical protein  23.44 
 
 		 636 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000692495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.33 
 
 		 806 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.56 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.14 
 
 		 746 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 		 764 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.71 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25 
 
 		 764 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25 
 
 		 764 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28 
 
 		 720 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  23.49 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  25 
 
 		 679 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.65 
 
 		 851 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  24.88 
 
 		 677 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  23.86 
 
 		 758 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.92 
 
 		 695 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  27.06 
 
 		 883 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.92 
 
 		 695 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  27.92 
 
 		 695 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.49 
 
 		 708 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>