36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1157 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  87.23 
 
 
189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  65.19 
 
 
189 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  64.09 
 
 
189 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  63.54 
 
 
188 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  63.54 
 
 
188 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  62.84 
 
 
188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  63.54 
 
 
188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  62.98 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  65.71 
 
 
272 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  65.71 
 
 
269 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  65.71 
 
 
197 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  65.71 
 
 
197 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  65.71 
 
 
197 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  65.71 
 
 
197 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  65.71 
 
 
197 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  71.62 
 
 
149 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  40.99 
 
 
217 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  43.45 
 
 
217 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  42.96 
 
 
217 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  46.77 
 
 
203 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  46.77 
 
 
203 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  29.73 
 
 
376 aa  62.4  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  30.6 
 
 
377 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  28.17 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  32.9 
 
 
361 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  31.76 
 
 
379 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  26.47 
 
 
350 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  24.36 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2369  membrane protein-like protein  23.08 
 
 
173 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  32.12 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  32.12 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.36 
 
 
395 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  31.85 
 
 
363 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>