102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1134 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  35.93 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  33.49 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  33.86 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  33.59 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  31.91 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  32.65 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  34.96 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  29.09 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  30.2 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.77 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  29.75 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  29.75 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  29.53 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.51 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  29.79 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  29.79 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  29.75 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  29.14 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  29.14 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  33.49 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.7 
 
 		 662 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  27.85 
 
 		 659 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  28.19 
 
 		 149 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  28.89 
 
 		 197 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.93 
 
 		 741 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.17 
 
 		 720 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  26.92 
 
 		 711 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  31.52 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  25 
 
 		 732 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  25 
 
 		 732 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.53 
 
 		 699 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  26.9 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  28.37 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  29.21 
 
 		 733 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  28.86 
 
 		 189 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  23.64 
 
 		 717 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  29.05 
 
 		 724 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.42 
 
 		 742 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.08 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.38 
 
 		 727 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.99 
 
 		 727 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02961  hypothetical membrane protein  25.52 
 
 		 737 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.38 
 
 		 727 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.38 
 
 		 727 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  27.5 
 
 		 733 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  28.24 
 
 		 720 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.47 
 
 		 724 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  27.65 
 
 		 717 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  27.65 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0430  membrane protein  27.57 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0785433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  27.65 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  27.65 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  27.65 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  27.65 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  27.65 
 
 		 720 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  27.65 
 
 		 717 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1783  hypothetical protein  27.57 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  32.5 
 
 		 203 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  32.5 
 
 		 203 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  29.86 
 
 		 724 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  23.42 
 
 		 713 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.98 
 
 		 728 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  27.6 
 
 		 638 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  26.25 
 
 		 733 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  30.06 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  30.06 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  26.98 
 
 		 729 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  30.77 
 
 		 679 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  23.75 
 
 		 717 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  27.06 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  27.06 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  27.06 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  27.06 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  27.06 
 
 		 717 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  25.17 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.86 
 
 		 730 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5250  intergral membrane protein  25.15 
 
 		 727 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.77 
 
 		 679 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  29.45 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  28.48 
 
 		 682 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  29.45 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  29.45 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  29.45 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  29.45 
 
 		 357 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  25.43 
 
 		 664 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.14 
 
 		 763 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  32.52 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0874  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.54 
 
 		 700 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.866014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>