38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1474 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  75.12 
 
 		 217 aa  292  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  81.52 
 
 		 217 aa  268  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  81.52 
 
 		 217 aa  267  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  35.22 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  37.74 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  37.74 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  35.85 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  34.59 
 
 		 188 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  34.59 
 
 		 188 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  34.59 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  35.71 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  41.14 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  39.56 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  35.92 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  29.71 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  31.93 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  28.29 
 
 		 359 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  34.88 
 
 		 363 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  32.5 
 
 		 376 aa  48.5  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  34.13 
 
 		 361 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.32 
 
 		 724 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  30 
 
 		 395 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  36.8 
 
 		 370 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  31.58 
 
 		 733 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2684  hypothetical protein  23.53 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  28.47 
 
 		 380 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  32.52 
 
 		 378 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.57 
 
 		 730 aa  41.6  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>