36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1207 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  99.49 
 
 
272 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  74.46 
 
 
188 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  73.91 
 
 
188 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  73.91 
 
 
188 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  97.99 
 
 
149 aa  294  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  75.82 
 
 
189 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  74.46 
 
 
189 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  73.37 
 
 
188 aa  287  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  73.37 
 
 
188 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  65.71 
 
 
238 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  65.14 
 
 
189 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  40.48 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  42.38 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  42.86 
 
 
217 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  37.6 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  37.6 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  29.22 
 
 
376 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  29.66 
 
 
360 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  32.28 
 
 
350 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28.99 
 
 
395 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  33.12 
 
 
363 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  30.37 
 
 
347 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  26.76 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  30.37 
 
 
338 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  26.2 
 
 
379 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  27.16 
 
 
380 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  29.51 
 
 
377 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  28.57 
 
 
717 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  26.81 
 
 
359 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>