47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2344 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  98.94 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  90.91 
 
 		 189 aa  348  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  88.3 
 
 		 188 aa  346  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  87.77 
 
 		 188 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  87.77 
 
 		 188 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  88.83 
 
 		 189 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  74.18 
 
 		 272 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  74.18 
 
 		 269 aa  270  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  73.37 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  73.37 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  73.37 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  73.37 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  73.37 
 
 		 197 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  76.35 
 
 		 149 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  62.98 
 
 		 238 aa  210  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  61.71 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  38.55 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  38.6 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  38.82 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  41.8 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  41.8 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  29.79 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  30.08 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  28.65 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28.91 
 
 		 395 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  29.69 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  30.6 
 
 		 350 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  31.11 
 
 		 361 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  33.11 
 
 		 363 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  25.19 
 
 		 347 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  29.75 
 
 		 380 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  30 
 
 		 677 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  28.47 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  28.47 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  29.29 
 
 		 679 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.29 
 
 		 679 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  29.29 
 
 		 679 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  25.4 
 
 		 758 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  24.87 
 
 		 758 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  24.87 
 
 		 758 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  24.87 
 
 		 758 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  24.87 
 
 		 758 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  28.57 
 
 		 679 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.57 
 
 		 679 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  23.74 
 
 		 345 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>