39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5647 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  93.62 
 
 
188 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  93.62 
 
 
188 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  92.55 
 
 
188 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  92.51 
 
 
189 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  88.83 
 
 
188 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  88.3 
 
 
188 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  75.82 
 
 
269 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  75.82 
 
 
272 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  75.82 
 
 
197 aa  277  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  75.82 
 
 
197 aa  277  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  75.82 
 
 
197 aa  277  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  75.82 
 
 
197 aa  277  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  75.82 
 
 
197 aa  277  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  78.08 
 
 
149 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  64.09 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  64.16 
 
 
189 aa  207  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  39.77 
 
 
217 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  37.35 
 
 
217 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  37.4 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  37.4 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  30.2 
 
 
376 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  27.46 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  29.24 
 
 
379 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  30.82 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  30.82 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28.46 
 
 
395 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  29.85 
 
 
350 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.52 
 
 
360 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  28.46 
 
 
347 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  32.19 
 
 
361 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  33.56 
 
 
363 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  25.35 
 
 
380 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  26.36 
 
 
338 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  29.08 
 
 
679 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.08 
 
 
679 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  29.08 
 
 
677 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  28.37 
 
 
679 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>