57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1329 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  90.37 
 
 		 217 aa  308  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  89.84 
 
 		 217 aa  307  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  75.12 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  75.12 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  37.35 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  40.48 
 
 		 269 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  40.48 
 
 		 272 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  38.55 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  38.55 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  40.48 
 
 		 197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  38.55 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  37.35 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  36.75 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  36.75 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  39.46 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  40.99 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  41.84 
 
 		 149 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  32.62 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  34.72 
 
 		 338 aa  68.6  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  35.29 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  30.94 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  35.71 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  37.8 
 
 		 361 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  30.82 
 
 		 395 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  35.11 
 
 		 350 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  30.77 
 
 		 724 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.43 
 
 		 746 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  27.04 
 
 		 708 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  32.23 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  28.98 
 
 		 711 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  30.22 
 
 		 733 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  29.55 
 
 		 721 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  29.5 
 
 		 712 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2855  hypothetical protein  29.01 
 
 		 711 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0061473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.61 
 
 		 746 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  30.16 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  23.84 
 
 		 649 aa  44.3  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  32.82 
 
 		 756 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.43 
 
 		 697 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  29.5 
 
 		 712 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  29.5 
 
 		 712 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  32.52 
 
 		 376 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  26.05 
 
 		 345 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  29.55 
 
 		 731 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.63 
 
 		 717 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  30.59 
 
 		 364 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  31.51 
 
 		 345 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  26.81 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  29.61 
 
 		 704 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2684  hypothetical protein  23.48 
 
 		 175 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  28.03 
 
 		 720 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>