57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12921 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  298  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1464  membrane protein-like  63.01 
 
 
151 aa  163  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  29.58 
 
 
188 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  29.58 
 
 
188 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  30.83 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  28.87 
 
 
188 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  30.08 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  29.93 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.78 
 
 
395 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.85 
 
 
360 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  28.77 
 
 
708 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  27.46 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  27.07 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  27.07 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  27.07 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  27.07 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  27.07 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  29.2 
 
 
238 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  26.76 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.33 
 
 
347 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  27.07 
 
 
272 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  27.07 
 
 
269 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  30.2 
 
 
359 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  33.57 
 
 
184 aa  50.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  30.3 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  31.58 
 
 
367 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2429  membrane protein-like protein  27.64 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.419091  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  26.52 
 
 
363 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2369  membrane protein-like protein  25.55 
 
 
173 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.57 
 
 
746 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  32.76 
 
 
193 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  26.76 
 
 
376 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.05 
 
 
653 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  26.39 
 
 
338 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  28.78 
 
 
361 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  30.77 
 
 
655 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  32.61 
 
 
362 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2849  hypothetical protein  28.81 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2535  hypothetical protein  28.81 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  29.86 
 
 
339 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  30.72 
 
 
687 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  27.39 
 
 
376 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  31.03 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  26.81 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  31.03 
 
 
640 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  31.03 
 
 
620 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  28.68 
 
 
217 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  28.68 
 
 
217 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  24.52 
 
 
721 aa  41.2  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  23.24 
 
 
364 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>