15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2369 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2369  membrane protein-like protein  100 
 
 
173 aa  339  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2429  membrane protein-like protein  52.2 
 
 
169 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.419091  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  48.98 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.1 
 
 
360 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  28.57 
 
 
338 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  27.73 
 
 
359 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  27.45 
 
 
347 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  25.55 
 
 
151 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1464  membrane protein-like  31.97 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  23.08 
 
 
238 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  30.25 
 
 
600 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  24.03 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  28.8 
 
 
217 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  30.36 
 
 
217 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>