36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1464 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1464  membrane protein-like  100 
 
 		 151 aa  293  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  63.01 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  27.61 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  35.4 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  27.61 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  26.12 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.66 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  26.12 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  26.12 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  28 
 
 		 395 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0610  transmembrane protein  31.03 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  27.85 
 
 		 655 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2429  membrane protein-like protein  28.35 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.419091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  27.61 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003309  hypothetical protein  37.88 
 
 		 451 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.934821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2369  membrane protein-like protein  31.97 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  24.63 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  28.17 
 
 		 708 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  25.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  25.74 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  25.74 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  26.87 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  25.74 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  25.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  25.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  25.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  25.74 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  34.04 
 
 		 659 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  27.27 
 
 		 193 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4736  hypothetical protein  28.06 
 
 		 392 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378543  normal  0.971977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  24.29 
 
 		 376 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.4 
 
 		 746 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  26.76 
 
 		 376 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  29.61 
 
 		 359 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2163  hypothetical protein  27.27 
 
 		 403 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>