144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003309 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003309  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  927    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.934821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  33.14 
 
 		 664 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  31.79 
 
 		 664 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  28.76 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  34.29 
 
 		 690 aa  70.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  28.03 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001146  hypothetical protein  26.83 
 
 		 724 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913629  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.33 
 
 		 697 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.26 
 
 		 698 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  25.47 
 
 		 681 aa  66.6  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  36.43 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.66 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  25.81 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.21 
 
 		 678 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  27.7 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  25.47 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.56 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  30.56 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  28.24 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  27.7 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.47 
 
 		 700 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  23.14 
 
 		 704 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.34 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  27.23 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  31.11 
 
 		 676 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.71 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  28.37 
 
 		 670 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  25.47 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  25.88 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  25.47 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.95 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  25.95 
 
 		 711 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  29.68 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3667  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.16 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  29.14 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4859  fusaric acid resistance protein region  31.91 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.93 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  29.14 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  24.69 
 
 		 635 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.77 
 
 		 726 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7722  fusaric acid resistance protein  26.8 
 
 		 710 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5813  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 		 707 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6177  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 		 707 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  28.77 
 
 		 725 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  27.81 
 
 		 728 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6657  fusaric acid resistance protein region  27.45 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.41 
 
 		 677 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6015  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 		 713 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  27.97 
 
 		 691 aa  53.5  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0264  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  28.57 
 
 		 662 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.09 
 
 		 672 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 651 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 651 aa  53.5  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 651 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5771  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 		 719 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.870894 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  29.14 
 
 		 724 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  28.48 
 
 		 724 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 		 687 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.71 
 
 		 655 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6148  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 		 710 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.623711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.85 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  29.87 
 
 		 700 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.12 
 
 		 679 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  29.29 
 
 		 714 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  23.75 
 
 		 625 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.22 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  24.14 
 
 		 354 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  27.78 
 
 		 679 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.52 
 
 		 680 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.76 
 
 		 752 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.32 
 
 		 655 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  26.71 
 
 		 731 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.32 
 
 		 725 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.88 
 
 		 729 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.14 
 
 		 692 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 		 732 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.32 
 
 		 655 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.32 
 
 		 655 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.32 
 
 		 655 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  29.11 
 
 		 376 aa  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.32 
 
 		 655 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3825  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  29.27 
 
 		 649 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  26.25 
 
 		 711 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  27.89 
 
 		 679 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 		 725 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.89 
 
 		 679 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  24.32 
 
 		 687 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  27.89 
 
 		 679 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  30.34 
 
 		 662 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  26.8 
 
 		 725 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.89 
 
 		 679 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>