58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001146 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001146  hypothetical protein  100 
 
 		 724 aa  1495    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003309  hypothetical protein  26.83 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.934821  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  25.66 
 
 		 676 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  22.07 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  22.07 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  22.07 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.29 
 
 		 678 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.56 
 
 		 678 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 		 732 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 		 678 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  28.48 
 
 		 731 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.48 
 
 		 664 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.58 
 
 		 664 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  22.6 
 
 		 733 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.82 
 
 		 653 aa  53.9  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  27.64 
 
 		 691 aa  53.9  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  21.42 
 
 		 744 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  30.1 
 
 		 726 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  28.21 
 
 		 725 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  26.22 
 
 		 659 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  23.12 
 
 		 736 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.91 
 
 		 739 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  27.34 
 
 		 731 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  27.34 
 
 		 731 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  22.32 
 
 		 699 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.54 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.55 
 
 		 722 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  30.07 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  30.07 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1137  hypothetical protein  23.08 
 
 		 640 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  30.07 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  29.37 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  29.58 
 
 		 733 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  29.58 
 
 		 733 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 		 727 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.95 
 
 		 676 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  23.91 
 
 		 690 aa  47.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  26.29 
 
 		 679 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0981  hypothetical protein  22.53 
 
 		 620 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  26.92 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.37 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.37 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.37 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.37 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.37 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.77 
 
 		 702 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.37 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.37 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.37 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 		 676 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  26.92 
 
 		 728 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  33.33 
 
 		 676 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  27.06 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.5 
 
 		 682 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  22.36 
 
 		 699 aa  45.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  30.34 
 
 		 727 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.06 
 
 		 742 aa  44.3  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>