50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2849 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2849  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  52.17 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  52.17 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  31.1 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1765  hypothetical protein  28.92 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.136775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  35.71 
 
 		 369 aa  68.2  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1753  hypothetical protein  26.88 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00376249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1771  hypothetical protein  28.3 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  26.35 
 
 		 328 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  30.19 
 
 		 368 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  23.97 
 
 		 708 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0311  hypothetical protein  31.76 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  28.05 
 
 		 328 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  28.05 
 
 		 328 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  26.88 
 
 		 364 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  26.88 
 
 		 364 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  24.14 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  30.66 
 
 		 363 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.14 
 
 		 347 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  28.83 
 
 		 381 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1572  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 362 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1604  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.966783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.11 
 
 		 360 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  28.22 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  28.22 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05920  expressed protein  23.02 
 
 		 1025 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  28.22 
 
 		 381 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1074  hypothetical protein  24.54 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  28.4 
 
 		 635 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  27.39 
 
 		 338 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  28.05 
 
 		 359 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  25.62 
 
 		 364 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  22.29 
 
 		 758 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001146  hypothetical protein  23.6 
 
 		 724 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003309  hypothetical protein  25.29 
 
 		 451 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.934821  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  28.44 
 
 		 697 aa  40.8  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  24.66 
 
 		 347 aa  40.8  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.57 
 
 		 691 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  24.66 
 
 		 347 aa  40.8  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>