54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1427 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  64.94 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  64.94 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2776  hypothetical protein  45 
 
 		 275 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2537  integral membrane protein  36.27 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000042014 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2478  hypothetical protein  39.07 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000608339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2513  hypothetical protein  39.07 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2557  hypothetical protein  35.21 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000442188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2743  hypothetical protein  35.21 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2751  hypothetical protein  35.36 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182894 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2797  hypothetical protein  35.5 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  35.48 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  34.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  34.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  29.9 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  31.51 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  26.94 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  33.12 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  26.83 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  22.98 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1438  membrane protein-like protein  22.12 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  29.53 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  29.53 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  32 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2288  protein of unknown function DUF939  28.89 
 
 		 325 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  25.96 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  22.62 
 
 		 676 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2535  hypothetical protein  26.35 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2849  hypothetical protein  26.35 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  28.09 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  28.09 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.66 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  23.21 
 
 		 662 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.14 
 
 		 734 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  23.93 
 
 		 724 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  23.93 
 
 		 724 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  23.46 
 
 		 734 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  23.46 
 
 		 734 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  23.85 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  23.21 
 
 		 662 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  23.46 
 
 		 734 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  24.73 
 
 		 733 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  24.73 
 
 		 733 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  26.49 
 
 		 432 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  25.42 
 
 		 708 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>