25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0311 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0311  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  351  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  46.91 
 
 
165 aa  141  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  31.72 
 
 
347 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2849  hypothetical protein  32.53 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2535  hypothetical protein  32.53 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  30.13 
 
 
360 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1765  hypothetical protein  26.06 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.136775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  30.19 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  29.3 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  26.49 
 
 
364 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  26.49 
 
 
364 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  25.83 
 
 
364 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1753  hypothetical protein  24.68 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00376249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  30.48 
 
 
374 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24.14 
 
 
655 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1771  hypothetical protein  28.67 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  21.85 
 
 
359 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>