80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7105 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  35.37 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  32.02 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  33.78 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  30.11 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  30.51 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  34.67 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  32.32 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  31.14 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  30.18 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  27.62 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  32.03 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  31.16 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  32.03 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  33.86 
 
 		 149 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  31.01 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  37.88 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  32.14 
 
 		 188 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  32.09 
 
 		 188 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  30.71 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  29.85 
 
 		 189 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 188 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  30.08 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05920  expressed protein  29.11 
 
 		 1025 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.78 
 
 		 696 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  31.3 
 
 		 189 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.27 
 
 		 746 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.52 
 
 		 695 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.13 
 
 		 724 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  31.7 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  26.53 
 
 		 719 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  24.54 
 
 		 708 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  26.22 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 		 690 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  25.61 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 		 690 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  27.06 
 
 		 695 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.06 
 
 		 695 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.06 
 
 		 695 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  25.61 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  27.06 
 
 		 695 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  25.61 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.46 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.41 
 
 		 690 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  26.46 
 
 		 700 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.46 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  23.49 
 
 		 717 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 		 711 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  26.46 
 
 		 700 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  27.08 
 
 		 732 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  30.6 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  28.79 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.46 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.46 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.85 
 
 		 706 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.46 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.46 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.37 
 
 		 727 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  34.65 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.19 
 
 		 706 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.19 
 
 		 706 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  34.65 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  27.08 
 
 		 732 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.1 
 
 		 720 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.46 
 
 		 696 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  26.57 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.56 
 
 		 727 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  25 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.56 
 
 		 727 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.56 
 
 		 727 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  27.1 
 
 		 770 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  30.06 
 
 		 725 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  20.95 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  20.95 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>