11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0430 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1783  hypothetical protein  98.63 
 
 		 364 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0430  membrane protein  100 
 
 		 364 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0785433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3993  hypothetical protein  43.14 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0182739  normal  0.26526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  28.5 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  29.6 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 679 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32 
 
 		 699 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  31.21 
 
 		 700 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  26.79 
 
 		 679 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  28.69 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  32.53 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>