22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2756 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  100 
 
 		 427 aa  821    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  56.8 
 
 		 497 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  38.75 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  38.56 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  27.75 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  32.03 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  25.99 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  30.57 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  24.6 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  30.27 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  26.6 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  25.96 
 
 		 328 aa  50.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  29.05 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  27.88 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  25.52 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  27.87 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  25.76 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  25.76 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  27.78 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  30.23 
 
 		 341 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>