98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0108 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0108  phage integrase family protein  100 
 
 
321 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0056  phage integrase family protein  99.69 
 
 
318 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0033  phage integrase family protein  95.6 
 
 
318 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155571 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0026  hypothetical protein  84.44 
 
 
315 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.455463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3738  phage integrase family site specific recombinase  56.27 
 
 
321 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3720  site-specific recombinase, phage integrase family  56.27 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98037e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3556  phage integrase family site specific recombinase  56.27 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2388  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  56.91 
 
 
319 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00713056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3455  phage integrase family protein  56.27 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  56.27 
 
 
321 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3840  phage integrase family site specific recombinase  56.27 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3468  phage integrase family protein  56.27 
 
 
321 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  55.63 
 
 
320 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3761  site-specific recombinase, phage integrase family  56.27 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000305739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  55.95 
 
 
321 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  47.21 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0101  phage integrase family site specific recombinase  48.66 
 
 
272 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0027  phage integrase domain protein SAM domain protein  34.31 
 
 
308 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032761  normal  0.165851 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0162  DNA integration/recombination/invertion protein  32.12 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.94 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.45 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.79 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.31 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.79 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.45 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.45 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.52 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.15 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 
300 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  23.1 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  21.25 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.15 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  22.48 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.38 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.95 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  27.41 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  20.89 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  21.83 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.73 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  22.4 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25.46 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  24.57 
 
 
325 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.62 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  18.06 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.72 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  20.88 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.9 
 
 
297 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  21.57 
 
 
291 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  21.89 
 
 
323 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.53 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.46 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  21.86 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.72 
 
 
299 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  29.03 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  24.7 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  29.03 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  29.03 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  29.03 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  23.17 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  27.86 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  20.77 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  21.07 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  20.35 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1861  phage integrase  23.6 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.168133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.07 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.07 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.02 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  20 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  20.92 
 
 
299 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  22.22 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  20.36 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.51 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  23.1 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.8 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.62 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  23.28 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  20.74 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  21.25 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  23.26 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  23.26 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  18.75 
 
 
308 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.24 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>