58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3810 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3738  phage integrase family site specific recombinase  96.56 
 
 
321 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3761  site-specific recombinase, phage integrase family  96.57 
 
 
321 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000305739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3556  phage integrase family site specific recombinase  95.94 
 
 
321 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3455  phage integrase family protein  96.25 
 
 
321 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3468  phage integrase family protein  95.94 
 
 
321 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
321 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3840  phage integrase family site specific recombinase  95.94 
 
 
321 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  99.38 
 
 
321 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3720  site-specific recombinase, phage integrase family  95.94 
 
 
321 aa  637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98037e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  92.81 
 
 
320 aa  618  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2388  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  81.5 
 
 
319 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00713056  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  62.42 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0033  phage integrase family protein  56.27 
 
 
318 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155571 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0108  phage integrase family protein  56.27 
 
 
321 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0056  phage integrase family protein  56.27 
 
 
318 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0026  hypothetical protein  53.67 
 
 
315 aa  360  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.455463  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0101  phage integrase family site specific recombinase  56.72 
 
 
272 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0027  phage integrase domain protein SAM domain protein  35.53 
 
 
308 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032761  normal  0.165851 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0162  DNA integration/recombination/invertion protein  33.98 
 
 
293 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  24.21 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  19.74 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  24.29 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  22.11 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  23.08 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  21.38 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  22.62 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  22.71 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  23.83 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  22.26 
 
 
296 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  22 
 
 
332 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.22 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0214  site-specific recombinase XerD  20.07 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  21.79 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  21.79 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  21.79 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  21.79 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  23.43 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.18 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  23.48 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  20.92 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.55 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  27.54 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  23.57 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  20.86 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  20.64 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  23.74 
 
 
357 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  22.57 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  22.11 
 
 
300 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  23.23 
 
 
358 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  25.72 
 
 
324 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  24.35 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>