74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2388 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2388  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00713056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3738  phage integrase family site specific recombinase  81.19 
 
 
321 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3556  phage integrase family site specific recombinase  81.5 
 
 
321 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3455  phage integrase family protein  81.5 
 
 
321 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3468  phage integrase family protein  81.5 
 
 
321 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3720  site-specific recombinase, phage integrase family  81.5 
 
 
321 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98037e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  81.5 
 
 
321 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3761  site-specific recombinase, phage integrase family  81.5 
 
 
321 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000305739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3840  phage integrase family site specific recombinase  81.5 
 
 
321 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  81.82 
 
 
320 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  80.88 
 
 
321 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  61.94 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0033  phage integrase family protein  56.91 
 
 
318 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155571 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0056  phage integrase family protein  56.91 
 
 
318 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0108  phage integrase family protein  56.91 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0026  hypothetical protein  54.66 
 
 
315 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.455463  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0101  phage integrase family site specific recombinase  59.7 
 
 
272 aa  338  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0027  phage integrase domain protein SAM domain protein  36.57 
 
 
308 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032761  normal  0.165851 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0162  DNA integration/recombination/invertion protein  33.89 
 
 
293 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  20.7 
 
 
332 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.29 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  21.88 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  21.17 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  20.85 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  25.11 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.37 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  22.33 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  21.38 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  22.62 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  21.68 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  23.28 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  21 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  22.76 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  26.44 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  26.44 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  21.97 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  26.44 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  19.59 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  22.65 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  20.13 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  22.22 
 
 
304 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  24.52 
 
 
292 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  18.09 
 
 
295 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  20.2 
 
 
298 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  21.05 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  25.34 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  23.66 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  22.3 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  21.7 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5176  integrase family protein  26.38 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.795183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  20.42 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  22.86 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  21.82 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  20.51 
 
 
351 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  20.51 
 
 
351 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  20.51 
 
 
351 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  20.51 
 
 
351 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.83 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  21.88 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  21.52 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  20.42 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.47 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.09 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  22.22 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  18.81 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.5 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 
291 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3699  phage integrase family protein  25.23 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  23.57 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  22.6 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  20.85 
 
 
379 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.59 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  24.28 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25.36 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>