46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3476 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  662    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3761  site-specific recombinase, phage integrase family  94.06 
 
 
321 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000305739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3455  phage integrase family protein  93.75 
 
 
321 aa  627  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3738  phage integrase family site specific recombinase  93.44 
 
 
321 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3556  phage integrase family site specific recombinase  93.75 
 
 
321 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3468  phage integrase family protein  93.75 
 
 
321 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3720  site-specific recombinase, phage integrase family  93.75 
 
 
321 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98037e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3840  phage integrase family site specific recombinase  93.75 
 
 
321 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  92.81 
 
 
321 aa  618  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  92.19 
 
 
321 aa  614  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2388  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  81.82 
 
 
319 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00713056  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  60.13 
 
 
326 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0033  phage integrase family protein  55.63 
 
 
318 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155571 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0056  phage integrase family protein  55.63 
 
 
318 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0108  phage integrase family protein  55.63 
 
 
321 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0026  hypothetical protein  53.67 
 
 
315 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.455463  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0101  phage integrase family site specific recombinase  57.84 
 
 
272 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0027  phage integrase domain protein SAM domain protein  35.28 
 
 
308 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032761  normal  0.165851 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0162  DNA integration/recombination/invertion protein  33.87 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  19.35 
 
 
290 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  19.03 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  26.4 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  25.49 
 
 
298 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  19.74 
 
 
332 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.41 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  22.82 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.37 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  21.33 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.23 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  21.15 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  17.81 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0306  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  36.92 
 
 
253 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  21.63 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.01 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  21.63 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  21.63 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  21.63 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  22.5 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  21.57 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  21.2 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  20.85 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>