43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0306 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0306  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1596  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  41.53 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1399  site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein  32.26 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.72 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.29 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.14 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  29.12 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.02 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.46 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.36 
 
 		 294 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.34 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  25.84 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.75 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  26.37 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  29.37 
 
 		 374 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  25.51 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  25.93 
 
 		 329 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.83 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  22.05 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  25.67 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  36.92 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  28 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.12 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4563  integrase domain protein SAM domain protein  24.54 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.71 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  51.43 
 
 		 471 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  51.43 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  24.38 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  21.53 
 
 		 367 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  25.49 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  22.56 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  36.92 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  36.92 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33.8 
 
 		 378 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.71 
 
 		 293 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>