50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3761 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3738  phage integrase family site specific recombinase  99.38 
 
 
321 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3761  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
321 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000305739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3556  phage integrase family site specific recombinase  99.38 
 
 
321 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3455  phage integrase family protein  99.69 
 
 
321 aa  661    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3468  phage integrase family protein  99.06 
 
 
321 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3810  site-specific recombinase, phage integrase family  96.57 
 
 
321 aa  643    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1495  site-specific recombinase, phage integrase family  95.95 
 
 
321 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1238  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3840  phage integrase family site specific recombinase  99.38 
 
 
321 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3720  site-specific recombinase, phage integrase family  99.38 
 
 
321 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98037e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3476  integrase domain-containing protein  94.06 
 
 
320 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0808383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2388  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  81.5 
 
 
319 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00713056  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0066  DNA integration/recombination/invertion protein  61.76 
 
 
326 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0033  phage integrase family protein  56.27 
 
 
318 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155571 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0026  hypothetical protein  54.31 
 
 
315 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.455463  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0108  phage integrase family protein  56.27 
 
 
321 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0056  phage integrase family protein  56.27 
 
 
318 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0101  phage integrase family site specific recombinase  56.72 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0027  phage integrase domain protein SAM domain protein  35.41 
 
 
308 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032761  normal  0.165851 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0162  DNA integration/recombination/invertion protein  34.3 
 
 
293 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  22.96 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  19.41 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  19.08 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  23.34 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  22 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0214  site-specific recombinase XerD  20.42 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.53 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  21.4 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  21.28 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  23.83 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  20.64 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  23.73 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.22 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  24.5 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3699  phage integrase family protein  23.46 
 
 
288 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.11 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  26.92 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  22.53 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  21.14 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  22.57 
 
 
283 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  21.14 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  21.14 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  21.14 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  23.47 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  20.67 
 
 
292 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  22.77 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  22.88 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  21.67 
 
 
332 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  24.72 
 
 
290 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>