More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4456 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  74.83 
 
 		 576 aa  894    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  72.11 
 
 		 577 aa  837    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 574 aa  1179    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  84.55 
 
 		 576 aa  994    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  84.38 
 
 		 576 aa  990    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  69.68 
 
 		 587 aa  827    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  90.24 
 
 		 574 aa  1060    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  70.9 
 
 		 576 aa  809    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  90.77 
 
 		 574 aa  1061    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  83.71 
 
 		 577 aa  967    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  79.09 
 
 		 575 aa  934    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  81.08 
 
 		 576 aa  960    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  84.2 
 
 		 576 aa  989    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  69.77 
 
 		 577 aa  788    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  83.02 
 
 		 577 aa  960    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  56.27 
 
 		 568 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  54.23 
 
 		 558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  53.27 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  55.62 
 
 		 561 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  52.74 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  53.94 
 
 		 566 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  54.3 
 
 		 568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  53.29 
 
 		 588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  53.24 
 
 		 567 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  53.53 
 
 		 571 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  52.66 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 558 aa  558  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  51.95 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  51.68 
 
 		 572 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  52.32 
 
 		 558 aa  558  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 		 565 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  51.42 
 
 		 580 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 		 589 aa  555  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  49.29 
 
 		 563 aa  553  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  51.42 
 
 		 580 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  52.68 
 
 		 573 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  51.42 
 
 		 580 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  51.42 
 
 		 582 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  51.94 
 
 		 588 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  52.67 
 
 		 578 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  47.95 
 
 		 564 aa  550  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  51.6 
 
 		 573 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  52.58 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 559 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 		 567 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 559 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  52.48 
 
 		 579 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  47.48 
 
 		 563 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  52.58 
 
 		 575 aa  545  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  51.26 
 
 		 570 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  52.18 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 578 aa  543  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  48.95 
 
 		 579 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  48.36 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 567 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  47.12 
 
 		 563 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 		 563 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  49.74 
 
 		 580 aa  538  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 562 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 561 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  52.32 
 
 		 658 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 571 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  47.69 
 
 		 564 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  47.51 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  51.01 
 
 		 552 aa  528  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  48.18 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  48.36 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  48.94 
 
 		 577 aa  531  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  47.39 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 561 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  48.45 
 
 		 560 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 561 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  45.85 
 
 		 559 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  50.98 
 
 		 571 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  46.91 
 
 		 564 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  45.85 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  46.52 
 
 		 564 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 564 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 564 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 		 568 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  45.67 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  46.73 
 
 		 563 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  45.49 
 
 		 557 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 564 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  46.67 
 
 		 564 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  46.4 
 
 		 562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1920  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 		 559 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 		 555 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  46.81 
 
 		 564 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  46.01 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  45.36 
 
 		 564 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  46.56 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>