More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3009 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  76.53 
 
 		 557 aa  893    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  68.46 
 
 		 567 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  76.27 
 
 		 557 aa  873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  864    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  76.45 
 
 		 557 aa  858    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  77.08 
 
 		 557 aa  883    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  78.82 
 
 		 560 aa  920    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  65.88 
 
 		 557 aa  734    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  82.59 
 
 		 560 aa  949    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  76.45 
 
 		 557 aa  879    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  864    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  67.51 
 
 		 563 aa  762    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  86 
 
 		 568 aa  986    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  60.51 
 
 		 557 aa  711    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  62.27 
 
 		 556 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  74.95 
 
 		 557 aa  871    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  76.71 
 
 		 557 aa  894    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  68.23 
 
 		 562 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  69.49 
 
 		 563 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  76.63 
 
 		 557 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  61.23 
 
 		 557 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  76.63 
 
 		 557 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  64.2 
 
 		 557 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  64.38 
 
 		 557 aa  733    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  61.3 
 
 		 556 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  61.05 
 
 		 557 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  62.45 
 
 		 556 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  69.13 
 
 		 557 aa  774    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  76.27 
 
 		 557 aa  877    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  75.54 
 
 		 557 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  60.87 
 
 		 559 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  73.07 
 
 		 563 aa  849    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  70.5 
 
 		 564 aa  768    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  82.68 
 
 		 564 aa  943    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  63.47 
 
 		 556 aa  729    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  83.33 
 
 		 564 aa  971    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  76.45 
 
 		 557 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  73.61 
 
 		 564 aa  855    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  87.77 
 
 		 564 aa  1023    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  76.71 
 
 		 557 aa  885    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  63.2 
 
 		 564 aa  722    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  76.63 
 
 		 557 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  860    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  66.43 
 
 		 561 aa  752    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 564 aa  1152    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  67.39 
 
 		 561 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  63.2 
 
 		 563 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  65.83 
 
 		 561 aa  749    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  76.09 
 
 		 557 aa  857    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  76.63 
 
 		 557 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  860    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  67.15 
 
 		 561 aa  755    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  86.83 
 
 		 564 aa  1008    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  87.77 
 
 		 564 aa  1023    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  67.33 
 
 		 561 aa  755    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  76.81 
 
 		 557 aa  864    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  60.65 
 
 		 565 aa  690    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  65.88 
 
 		 557 aa  723    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  84.02 
 
 		 564 aa  969    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  56.7 
 
 		 562 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  55.61 
 
 		 570 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2151  dihydroxy-acid dehydratase  52.51 
 
 		 561 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.950442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  53.42 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2863  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0663507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  50.89 
 
 		 569 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1920  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 		 559 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3418  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 		 565 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3684  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 561 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0646583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 573 aa  549  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 557 aa  550  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1312  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.462059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  50.82 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3745  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 562 aa  544  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75802  dihydroxyacid dehydratase  48.59 
 
 		 604 aa  543  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  47.93 
 
 		 559 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  49.29 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 567 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 569 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 566 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3236  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000356342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 554 aa  531  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 566 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3020  dihydroxy-acid dehydratase  51.14 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  50.73 
 
 		 575 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  49.03 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 565 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  46.91 
 
 		 576 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 572 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20547  homeobox protein  47.75 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  47.2 
 
 		 580 aa  525  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  49.27 
 
 		 554 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  48.57 
 
 		 589 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  48.04 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>