More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1326 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  64.17 
 
 		 592 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  62.23 
 
 		 559 aa  720    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  63.13 
 
 		 559 aa  728    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  62.43 
 
 		 573 aa  703    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  66.97 
 
 		 566 aa  735    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 566 aa  1128    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  61.15 
 
 		 562 aa  678    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  53.1 
 
 		 554 aa  588  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  53.26 
 
 		 554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 		 557 aa  578  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  55.25 
 
 		 576 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0291  dihydroxyacid dehydratase  54.91 
 
 		 574 aa  568  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.20791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  52.51 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  53.57 
 
 		 576 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  52.39 
 
 		 580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  53.68 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  53.94 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  53.57 
 
 		 576 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  54.15 
 
 		 575 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  54.59 
 
 		 577 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  53.57 
 
 		 576 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  53.16 
 
 		 574 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 564 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  52.53 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  54.17 
 
 		 576 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  54.41 
 
 		 577 aa  555  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 577 aa  555  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 565 aa  548  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  53.71 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  54.5 
 
 		 595 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 562 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 563 aa  542  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 567 aa  542  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 		 564 aa  538  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  51.43 
 
 		 575 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  47.65 
 
 		 561 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 		 558 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 561 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 		 563 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 		 561 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  48.1 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 564 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 572 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 557 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 567 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 		 559 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  51.87 
 
 		 563 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 575 aa  531  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 569 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  47.47 
 
 		 563 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  48.46 
 
 		 564 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 564 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  45.93 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 565 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  48.18 
 
 		 558 aa  522  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  47.02 
 
 		 557 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  48.46 
 
 		 560 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 567 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 		 563 aa  521  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 557 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 573 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  46.65 
 
 		 557 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  48.1 
 
 		 557 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  49.28 
 
 		 582 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  46.84 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 		 564 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 557 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 557 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  48.46 
 
 		 568 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 		 564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>