More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1524 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  95.23 
 
 		 588 aa  1097    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  56.72 
 
 		 568 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 588 aa  1175    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  91.48 
 
 		 588 aa  1053    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  57.22 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  58.21 
 
 		 561 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  54.42 
 
 		 578 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  55.69 
 
 		 658 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  52.53 
 
 		 576 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  52.97 
 
 		 576 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  52.62 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  52.97 
 
 		 576 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  51.77 
 
 		 587 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  51.68 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  52.93 
 
 		 574 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  52.54 
 
 		 577 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  53.09 
 
 		 575 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 		 574 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  52.11 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 		 577 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 574 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  51.06 
 
 		 576 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  50.35 
 
 		 577 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  45.33 
 
 		 559 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  47.25 
 
 		 575 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  44.44 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  44.89 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  45.07 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 		 575 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  47.2 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  47.42 
 
 		 558 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  47.07 
 
 		 569 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  46.45 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  45.15 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  45.92 
 
 		 573 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  45.57 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  46.56 
 
 		 578 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  43.69 
 
 		 563 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  45.31 
 
 		 582 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  46.67 
 
 		 562 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  45.83 
 
 		 580 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  45.83 
 
 		 580 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  45.83 
 
 		 580 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 		 565 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  43.92 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  44.5 
 
 		 563 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  44.76 
 
 		 567 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  45.88 
 
 		 580 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  46.37 
 
 		 573 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  45.65 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  44.6 
 
 		 557 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  44.94 
 
 		 557 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  42.81 
 
 		 556 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  43.84 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  45.13 
 
 		 563 aa  473  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  44.86 
 
 		 554 aa  472  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  43.56 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  44.37 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  45.05 
 
 		 558 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  44.15 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  44.07 
 
 		 557 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  45.29 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  44.4 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  44.25 
 
 		 557 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  42.45 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  42.45 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 563 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  46.98 
 
 		 575 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 		 570 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  45.18 
 
 		 579 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  46.02 
 
 		 564 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  48.07 
 
 		 595 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  44.78 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  44.52 
 
 		 562 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  44.17 
 
 		 561 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  42.76 
 
 		 564 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  41.34 
 
 		 561 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  45.05 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  45.12 
 
 		 579 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 		 571 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  45.26 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  44.13 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  43.64 
 
 		 561 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  45.29 
 
 		 566 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  45.84 
 
 		 571 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  44.68 
 
 		 562 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  45.83 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  44.06 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  44.4 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  42.05 
 
 		 563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  43.34 
 
 		 564 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  42.23 
 
 		 554 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  41.9 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  44.6 
 
 		 592 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  41.88 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  42.42 
 
 		 557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  43.13 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>