More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1925 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  60.9 
 
 		 558 aa  690    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 561 aa  1126    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  64.16 
 
 		 563 aa  739    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  83.36 
 
 		 564 aa  966    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  89.27 
 
 		 564 aa  1022    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  95 
 
 		 562 aa  1081    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  54.97 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 558 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 570 aa  521  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 569 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  48.93 
 
 		 582 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 576 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  49.29 
 
 		 565 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  48.75 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 573 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 		 558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  48.58 
 
 		 575 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  47.21 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 570 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 		 559 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 		 559 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  46.64 
 
 		 573 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  47.58 
 
 		 566 aa  508  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  47.22 
 
 		 580 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  46.85 
 
 		 561 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 567 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  48.13 
 
 		 573 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  46.93 
 
 		 562 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  47.59 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  46.13 
 
 		 556 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  48.81 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  46.86 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  48.3 
 
 		 580 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  46.11 
 
 		 563 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  45.34 
 
 		 561 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  45.59 
 
 		 564 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  48.3 
 
 		 580 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  48.3 
 
 		 580 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  46.82 
 
 		 562 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  45.95 
 
 		 561 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  45.19 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  48.74 
 
 		 570 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  47.66 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  47.86 
 
 		 589 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 		 563 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  47.03 
 
 		 578 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  46.88 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  47.12 
 
 		 592 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  45.05 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  47.24 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  44.68 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 		 566 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  45.95 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  44.4 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  44.5 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  44.4 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  48.31 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  47.06 
 
 		 576 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  47.76 
 
 		 576 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  43.86 
 
 		 559 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  47.58 
 
 		 575 aa  485  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  46.11 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  47.86 
 
 		 579 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  46.84 
 
 		 587 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  44.88 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  45.78 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  45.71 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  45.16 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  44.48 
 
 		 563 aa  485  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  44.77 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  45.34 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  48.29 
 
 		 571 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  45.52 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  45.16 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  44.19 
 
 		 564 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  44.62 
 
 		 557 aa  478  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  44.8 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  44.7 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  45.16 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  45 
 
 		 574 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  45.89 
 
 		 574 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  47.06 
 
 		 575 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  44.62 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  46.21 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  47.24 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  44.1 
 
 		 565 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  46.25 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>