More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1844 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  84.86 
 
 
554 aa  957    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  57.25 
 
 
559 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
554 aa  1115    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  57.43 
 
 
559 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  55.92 
 
 
566 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  53.65 
 
 
573 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.72 
 
 
557 aa  597  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  53.26 
 
 
566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
561 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
556 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
556 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
556 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
556 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
580 aa  555  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  52.36 
 
 
564 aa  551  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
561 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
557 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
561 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
579 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
557 aa  548  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  49.18 
 
 
561 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
567 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  49.27 
 
 
562 aa  544  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  52.01 
 
 
592 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 
564 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 
561 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 
557 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
563 aa  538  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  50.46 
 
 
576 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  51.18 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 
560 aa  538  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 
562 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 
563 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
558 aa  532  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
563 aa  534  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 
557 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 
564 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
563 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0291  dihydroxyacid dehydratase  52.08 
 
 
574 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.20791 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
567 aa  533  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 
557 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 
560 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  47.01 
 
 
557 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 
559 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 
578 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
562 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 
564 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 
564 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 
564 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 
564 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 
577 aa  528  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 
564 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
557 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  48.73 
 
 
557 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 
563 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  49.27 
 
 
564 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  48.37 
 
 
564 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  47.09 
 
 
565 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  48 
 
 
557 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
564 aa  520  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 
557 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
557 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
558 aa  520  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  48.37 
 
 
557 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 
571 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 
561 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  47.09 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  48.36 
 
 
557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 
576 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 
557 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  46.91 
 
 
557 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 
557 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  47.09 
 
 
557 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
557 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
547 aa  510  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  48.46 
 
 
567 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  47.75 
 
 
562 aa  510  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  48.45 
 
 
558 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 
570 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  47.73 
 
 
564 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  49.45 
 
 
575 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 
577 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 
547 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  46.92 
 
 
554 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  46.2 
 
 
552 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 
575 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 
576 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.941332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>