More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2713 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  81.7 
 
 		 552 aa  954    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  58.48 
 
 		 557 aa  655    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  65.94 
 
 		 551 aa  747    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  62.12 
 
 		 555 aa  689    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  65.52 
 
 		 553 aa  737    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 557 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  71.09 
 
 		 559 aa  792    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 557 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  56.5 
 
 		 557 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 557 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  64.61 
 
 		 556 aa  749    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  60.72 
 
 		 557 aa  681    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 557 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 557 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  60.69 
 
 		 552 aa  694    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  58.41 
 
 		 550 aa  635    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  56.96 
 
 		 557 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  58.63 
 
 		 559 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  60.11 
 
 		 556 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  62.88 
 
 		 555 aa  727    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 557 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  64.56 
 
 		 558 aa  741    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  58.12 
 
 		 559 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  64.67 
 
 		 552 aa  764    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  57.89 
 
 		 566 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 557 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 554 aa  1120    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  62.48 
 
 		 555 aa  700    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  66.37 
 
 		 557 aa  761    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  58.78 
 
 		 565 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  70.55 
 
 		 554 aa  821    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  73.91 
 
 		 552 aa  846    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  62.3 
 
 		 555 aa  692    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  61.55 
 
 		 556 aa  707    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  63.22 
 
 		 555 aa  712    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  70.11 
 
 		 557 aa  786    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  57.69 
 
 		 554 aa  668    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  57.5 
 
 		 554 aa  666    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  66.37 
 
 		 553 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 		 556 aa  697    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  60.14 
 
 		 552 aa  679    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  56.5 
 
 		 557 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  64.44 
 
 		 557 aa  754    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  56.5 
 
 		 557 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  66.85 
 
 		 560 aa  770    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  58.24 
 
 		 563 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  64.61 
 
 		 554 aa  728    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 557 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  58.95 
 
 		 550 aa  655    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  57.89 
 
 		 565 aa  653    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  57.71 
 
 		 554 aa  639    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  59.21 
 
 		 558 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  61.64 
 
 		 560 aa  694    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  58.95 
 
 		 550 aa  670    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  69.33 
 
 		 554 aa  792    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  58.23 
 
 		 550 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  57.17 
 
 		 579 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  56.81 
 
 		 565 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  55.76 
 
 		 553 aa  625  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  57.69 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  57.19 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  57.01 
 
 		 548 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  57.17 
 
 		 565 aa  623  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  54.87 
 
 		 558 aa  624  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  53.6 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  53.42 
 
 		 562 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  53.54 
 
 		 547 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 		 562 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 		 562 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  54.18 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  52.7 
 
 		 580 aa  589  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  50.71 
 
 		 561 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  53.71 
 
 		 547 aa  586  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  52.95 
 
 		 558 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  53.44 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  53.89 
 
 		 550 aa  581  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  52.95 
 
 		 613 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  52.8 
 
 		 579 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 		 553 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  51.73 
 
 		 577 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  54.07 
 
 		 550 aa  569  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  51.45 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  54.41 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  51.36 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 558 aa  558  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 558 aa  554  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2747  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  52.24 
 
 		 560 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 		 562 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 560 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1494  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 560 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 561 aa  542  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  48.57 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>