More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1599 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  58.11 
 
 
559 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  84.86 
 
 
554 aa  957    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  57.74 
 
 
559 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
554 aa  1115    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  55.29 
 
 
573 aa  621  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  58.29 
 
 
566 aa  623  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  53.1 
 
 
566 aa  588  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  51.36 
 
 
561 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  51.36 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 
564 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
561 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
561 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
561 aa  551  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
562 aa  547  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
563 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
580 aa  544  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
567 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 
561 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
556 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
557 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  48.73 
 
 
564 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
556 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  51.64 
 
 
592 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
563 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
562 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 
556 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
557 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 
576 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  50.91 
 
 
557 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 
557 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
556 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
560 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
564 aa  529  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 
564 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
564 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  50.64 
 
 
567 aa  531  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
564 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
579 aa  531  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  48.37 
 
 
565 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 
559 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 
564 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
563 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0291  dihydroxyacid dehydratase  51.42 
 
 
574 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.20791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
563 aa  525  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 
564 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 
557 aa  522  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
560 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  48.81 
 
 
571 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
557 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 
564 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  48.1 
 
 
563 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
562 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  48.73 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  46.47 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  46.65 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  46.47 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 
558 aa  513  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
564 aa  511  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 
578 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 
564 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 
568 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 
558 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 
577 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  48 
 
 
557 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
557 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 
561 aa  509  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
558 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  47.09 
 
 
557 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 
557 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  48.46 
 
 
562 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  46.73 
 
 
557 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 
557 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 
557 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 
557 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 
564 aa  501  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 
570 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  49.27 
 
 
575 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
557 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  47.93 
 
 
582 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  46.18 
 
 
557 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
557 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  46.18 
 
 
557 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  48.1 
 
 
567 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 
574 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
576 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  47.89 
 
 
567 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  48.27 
 
 
558 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 
576 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 
576 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  47.29 
 
 
572 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>