More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3010 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  73.78 
 
 		 576 aa  884    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  74.87 
 
 		 577 aa  880    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  73.95 
 
 		 576 aa  855    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 576 aa  1184    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  71.04 
 
 		 587 aa  854    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  73.96 
 
 		 574 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  72.22 
 
 		 576 aa  869    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  75 
 
 		 574 aa  877    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  77.08 
 
 		 575 aa  906    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  74 
 
 		 577 aa  882    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  74.52 
 
 		 577 aa  876    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  74.83 
 
 		 574 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  73.96 
 
 		 576 aa  885    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  73.44 
 
 		 577 aa  842    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  73.96 
 
 		 576 aa  885    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  54.2 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  56.29 
 
 		 558 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 561 aa  611  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  54.76 
 
 		 568 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  54.03 
 
 		 568 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  50.98 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  53.46 
 
 		 567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  53.45 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 573 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  52.57 
 
 		 588 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  52.24 
 
 		 582 aa  568  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  48.94 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 		 566 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 		 573 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 		 572 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 		 589 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 		 565 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  52.25 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 558 aa  555  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  50.52 
 
 		 580 aa  558  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 580 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 580 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 580 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  52.63 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 563 aa  552  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 564 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  52.42 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  48.73 
 
 		 561 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 561 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 575 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 		 557 aa  548  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 556 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 570 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  46.85 
 
 		 563 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  47.93 
 
 		 561 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  48.91 
 
 		 563 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  51.68 
 
 		 588 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  51.99 
 
 		 575 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 561 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 573 aa  547  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  47.39 
 
 		 563 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 		 579 aa  543  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 564 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 557 aa  545  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 566 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  47.42 
 
 		 564 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  50.46 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  51.33 
 
 		 588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 		 565 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  46.93 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 578 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  46.93 
 
 		 556 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 		 562 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  50.64 
 
 		 552 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  46.89 
 
 		 564 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  48.6 
 
 		 577 aa  537  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 		 561 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 563 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 564 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 		 564 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  48.5 
 
 		 562 aa  534  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  46.92 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  46.2 
 
 		 557 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  50.53 
 
 		 658 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  46.82 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 579 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  47.83 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  47.1 
 
 		 557 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 555 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  46.04 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  46.92 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  45.86 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  47.1 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  48.67 
 
 		 578 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>