More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0237 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  57.27 
 
 		 568 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 578 aa  1171    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  86.63 
 
 		 658 aa  981    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  69.95 
 
 		 568 aa  807    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  54.59 
 
 		 588 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  54.42 
 
 		 588 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  54.67 
 
 		 588 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  55.16 
 
 		 561 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  53.98 
 
 		 576 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  53.98 
 
 		 576 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  54.16 
 
 		 576 aa  581  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  52.74 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  53.98 
 
 		 577 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  53.63 
 
 		 577 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  53.57 
 
 		 574 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  52.82 
 
 		 574 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  53.01 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 		 576 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  50.62 
 
 		 577 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  52.67 
 
 		 574 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 576 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  49.57 
 
 		 587 aa  534  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  51.77 
 
 		 577 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  45.52 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  47.63 
 
 		 566 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  46.03 
 
 		 580 aa  482  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  45.25 
 
 		 579 aa  484  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  45.6 
 
 		 573 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  45.05 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  45.42 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  47.04 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  45.1 
 
 		 567 aa  478  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  46.77 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  44.19 
 
 		 582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 		 562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  45.18 
 
 		 563 aa  467  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  45.42 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  46.59 
 
 		 575 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  44.5 
 
 		 578 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  47.43 
 
 		 567 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  43.32 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  42.83 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  43.65 
 
 		 567 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  44.29 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  44.52 
 
 		 565 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  44.46 
 
 		 560 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  44.74 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  43.66 
 
 		 572 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  43.88 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  42.04 
 
 		 557 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  44.52 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  41.86 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  45.52 
 
 		 595 aa  455  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  44.68 
 
 		 570 aa  458  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  44.7 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  42.04 
 
 		 557 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  41.31 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  43.75 
 
 		 570 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  45.39 
 
 		 571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  44.15 
 
 		 564 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  44.32 
 
 		 554 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  44.36 
 
 		 573 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  42.27 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  44.15 
 
 		 564 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  43.74 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  43.67 
 
 		 562 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  43.45 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  43.67 
 
 		 557 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  43.53 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  42.25 
 
 		 561 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  43.98 
 
 		 564 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  42.42 
 
 		 563 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  43.49 
 
 		 557 aa  452  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  44.34 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  44.01 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  44.17 
 
 		 563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  42.75 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  46.53 
 
 		 592 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  44.01 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  42 
 
 		 564 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  42.38 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  42.68 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  41.73 
 
 		 552 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  42.27 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  41.04 
 
 		 556 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  42.35 
 
 		 562 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  42.91 
 
 		 580 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  43.09 
 
 		 580 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  42.91 
 
 		 580 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  41.04 
 
 		 556 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  41.89 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  41.92 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  41.89 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  41.89 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  41.83 
 
 		 564 aa  442  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  42.99 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  43.27 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  41.89 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>