More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0901 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  91.48 
 
 		 588 aa  1051    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 588 aa  1176    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  89.63 
 
 		 588 aa  1039    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  57.94 
 
 		 568 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  56.87 
 
 		 568 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  55.11 
 
 		 578 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  55.44 
 
 		 658 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  58.39 
 
 		 561 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  53.67 
 
 		 576 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  53.67 
 
 		 576 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  53.67 
 
 		 576 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 		 576 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  52.74 
 
 		 576 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  53.82 
 
 		 574 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  53.64 
 
 		 574 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  53.64 
 
 		 574 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  54.14 
 
 		 575 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  52.02 
 
 		 587 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  53.17 
 
 		 577 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  51.23 
 
 		 577 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  52.74 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  51.95 
 
 		 576 aa  538  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  51.32 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  48.42 
 
 		 567 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 575 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  46.11 
 
 		 573 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  47.18 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  43.59 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  48.13 
 
 		 558 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  44.39 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  46.44 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  43.76 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  46.09 
 
 		 573 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  43.59 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  46.02 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  47.07 
 
 		 569 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  46.54 
 
 		 575 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  43.69 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  44.96 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  42.63 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  45.31 
 
 		 563 aa  480  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  46.18 
 
 		 564 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  46.71 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  44.05 
 
 		 563 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  45.49 
 
 		 582 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  46.23 
 
 		 580 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 		 573 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  45.47 
 
 		 580 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  45.47 
 
 		 580 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 		 562 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  43.39 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  45.47 
 
 		 580 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  45.83 
 
 		 565 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  46.03 
 
 		 578 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  45.49 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  44.35 
 
 		 562 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  44.23 
 
 		 567 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  46.9 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  44.58 
 
 		 557 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  44.76 
 
 		 557 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  44.54 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  46.28 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  43.87 
 
 		 562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  45.29 
 
 		 589 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  44.21 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  44.76 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  44.27 
 
 		 558 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 567 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  44.76 
 
 		 564 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  44.19 
 
 		 559 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  45.36 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  47.84 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  44.37 
 
 		 567 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  46.18 
 
 		 563 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  45.84 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  42.73 
 
 		 564 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  44.62 
 
 		 561 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  44.7 
 
 		 558 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  43.34 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  43.52 
 
 		 557 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  46.62 
 
 		 575 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  43.95 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  45.18 
 
 		 566 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  41.34 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  45.29 
 
 		 579 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  43.11 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  41.39 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  41.39 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  42.81 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  42.6 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  47.37 
 
 		 595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  42.12 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  42.58 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  42.12 
 
 		 563 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  44.39 
 
 		 560 aa  452  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  43.64 
 
 		 566 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  43.69 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  43.33 
 
 		 557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  42.76 
 
 		 557 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  44.66 
 
 		 571 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>