More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3155 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
559 aa  1114    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  64.38 
 
 
566 aa  714    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  60.18 
 
 
562 aa  688    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  59.74 
 
 
573 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  62.23 
 
 
566 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  57.25 
 
 
554 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  97.85 
 
 
559 aa  1100    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  57.74 
 
 
554 aa  640    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  57.17 
 
 
592 aa  619  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.35 
 
 
557 aa  588  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
567 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  51.09 
 
 
561 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
561 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
561 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  52.54 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  52.08 
 
 
567 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 
567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  53.62 
 
 
564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  53.01 
 
 
562 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
563 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
564 aa  571  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
562 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
557 aa  568  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  51.52 
 
 
572 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
561 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  52.8 
 
 
558 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
563 aa  558  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
580 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 
571 aa  558  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
575 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
570 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  51.61 
 
 
563 aa  555  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  51.18 
 
 
563 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  50.45 
 
 
582 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  50.98 
 
 
573 aa  558  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
556 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 
557 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  50.71 
 
 
575 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 
558 aa  553  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  51.7 
 
 
575 aa  552  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 
569 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  48.91 
 
 
565 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 
576 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 
564 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
576 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
589 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
571 aa  548  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 
576 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
576 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  47.93 
 
 
564 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 
576 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  48.45 
 
 
557 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
577 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 
564 aa  541  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  48.73 
 
 
557 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 
564 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
580 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 
580 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
575 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0291  dihydroxyacid dehydratase  50.98 
 
 
574 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.20791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
567 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 
580 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
565 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 
564 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 
568 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
560 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  47.18 
 
 
556 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 
564 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  50.37 
 
 
576 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  47.57 
 
 
564 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  47.18 
 
 
556 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
557 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
557 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 
579 aa  536  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
573 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
570 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  47.28 
 
 
557 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 
558 aa  533  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 
578 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  46.65 
 
 
563 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 
595 aa  535  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  47.65 
 
 
564 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
563 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
577 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
560 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 
557 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  44.2 
 
 
557 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 
574 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  44.02 
 
 
557 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  46.92 
 
 
557 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  48.74 
 
 
574 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  46.74 
 
 
557 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  48.01 
 
 
557 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
571 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
558 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  44.2 
 
 
557 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  43.84 
 
 
559 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  47.28 
 
 
557 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>