More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0196 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  64.38 
 
 		 559 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 566 aa  1144    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  56.53 
 
 		 562 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  57.14 
 
 		 573 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1599  dihydroxy-acid dehydratase  58.29 
 
 		 554 aa  638    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0558675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  66.97 
 
 		 566 aa  751    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1017  dihydroxy-acid dehydratase  59.3 
 
 		 592 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  64.56 
 
 		 559 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  55.92 
 
 		 554 aa  630  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.8 
 
 		 557 aa  581  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  51.15 
 
 		 564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  52.8 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 579 aa  565  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 		 580 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  52.8 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0291  dihydroxyacid dehydratase  54.15 
 
 		 574 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.20791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  51.36 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 		 562 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 577 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 		 576 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 561 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 		 576 aa  554  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 574 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 564 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 563 aa  548  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 574 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 		 564 aa  545  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  50.53 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 578 aa  548  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 561 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  51.15 
 
 		 595 aa  542  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  51.09 
 
 		 567 aa  541  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 576 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 		 563 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 556 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 577 aa  538  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 		 574 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 561 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  51.53 
 
 		 563 aa  540  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 564 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 		 556 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 564 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  48.94 
 
 		 564 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  49.47 
 
 		 575 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  48.38 
 
 		 565 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 		 559 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  47.02 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  47.19 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  46.84 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  47.02 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 563 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 557 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  49.47 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  47.01 
 
 		 556 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 564 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  49.18 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  48.75 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  48.94 
 
 		 575 aa  528  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 558 aa  528  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  47.84 
 
 		 564 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  48.14 
 
 		 568 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  48.45 
 
 		 576 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  47.91 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 573 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 		 569 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  48.19 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  49.1 
 
 		 552 aa  518  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  48.1 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  48.65 
 
 		 572 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 		 563 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 570 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 560 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  49.19 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 554 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  48.09 
 
 		 558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  48.73 
 
 		 557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  48.13 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 		 567 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  48.37 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>