More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0324 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06346  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  63.68 
 
 		 613 aa  726    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0344315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2863  dihydroxy-acid dehydratase  61.91 
 
 		 557 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0663507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  60.62 
 
 		 562 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20547  homeobox protein  65.7 
 
 		 555 aa  769    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01530  dihydroxy-acid dehydratase, putative  62.54 
 
 		 596 aa  734    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 563 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 571 aa  1160    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  55.66 
 
 		 561 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  56.86 
 
 		 557 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  58.12 
 
 		 570 aa  642    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75802  dihydroxyacid dehydratase  61.2 
 
 		 604 aa  719    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3236  dihydroxy-acid dehydratase  68.47 
 
 		 557 aa  804    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000356342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3684  dihydroxy-acid dehydratase  62.34 
 
 		 561 aa  727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0646583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  63.06 
 
 		 569 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3745  dihydroxy-acid dehydratase  60.29 
 
 		 562 aa  714    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34354  predicted protein  66.85 
 
 		 567 aa  783    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.311045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1312  dihydroxy-acid dehydratase  58.09 
 
 		 570 aa  670    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.462059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1920  dihydroxy-acid dehydratase  62.88 
 
 		 559 aa  731    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  57.73 
 
 		 567 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  57.04 
 
 		 561 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  55.83 
 
 		 561 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3418  dihydroxy-acid dehydratase  61.11 
 
 		 565 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2151  dihydroxy-acid dehydratase  59.07 
 
 		 561 aa  705    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.950442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  58.3 
 
 		 558 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  55.18 
 
 		 561 aa  633  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  58.5 
 
 		 564 aa  629  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  55.78 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  54.69 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  55.6 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  55.32 
 
 		 564 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  55.23 
 
 		 561 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 563 aa  609  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  53.97 
 
 		 560 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  53.61 
 
 		 563 aa  607  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  51.43 
 
 		 563 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 564 aa  601  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 		 564 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  53.24 
 
 		 564 aa  598  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  53.53 
 
 		 556 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  53.24 
 
 		 564 aa  598  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  52.24 
 
 		 568 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  53.71 
 
 		 557 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  51.53 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 		 560 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  52.45 
 
 		 556 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 557 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  52.27 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  53.35 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04058  hypothetical dihydroxyacid dehydratase (Eurofung)  53.32 
 
 		 603 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0138326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 		 557 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  53.18 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 564 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  51 
 
 		 559 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3020  dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 		 574 aa  579  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  50.82 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  51.18 
 
 		 557 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  52.43 
 
 		 564 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 		 565 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 557 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  52.08 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 564 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  52.26 
 
 		 557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  52.08 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 557 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  52.77 
 
 		 567 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 557 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 559 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  53.25 
 
 		 558 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  52.7 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  53.71 
 
 		 571 aa  551  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  49.03 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  52.44 
 
 		 570 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  51.91 
 
 		 567 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 559 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  52.44 
 
 		 582 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  52.31 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 572 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  53.35 
 
 		 563 aa  541  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 		 569 aa  541  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 		 573 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  52.44 
 
 		 575 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 		 579 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>