More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2852 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0906727  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  36.92 
 
 
285 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
296 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6501  ABC transporter permease  37.29 
 
 
285 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126106  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  37.4 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  37.55 
 
 
259 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
296 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0749  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.29 
 
 
304 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111773  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119366  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  33.45 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
326 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
326 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
301 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125858  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
326 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
290 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.150151 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
283 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  34.97 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
305 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  34.94 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  32.07 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
283 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
290 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
326 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
288 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
288 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
290 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
283 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
325 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
289 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  32.85 
 
 
290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895819  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
285 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  35.58 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  31.56 
 
 
301 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
301 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2523  ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
290 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
669 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
285 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
308 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
284 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.53 
 
 
288 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0687674  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716489  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128667  normal  0.152984 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
314 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.279236  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1683  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.95 
 
 
323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
299 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317498  normal  0.323079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.361491  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
284 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
417 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4468  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.21 
 
 
302 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
418 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1835  ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 
293 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  32.07 
 
 
417 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
421 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
302 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
301 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
302 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
277 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
291 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.990505  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.16 
 
 
392 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0347  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
286 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 
301 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
416 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
597 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
283 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
362 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
291 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
423 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  34.76 
 
 
412 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1237  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
308 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.407263  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
322 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
287 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
314 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.24473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  26.27 
 
 
286 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
413 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211882  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
289 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270331  normal  0.616396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>