More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2002 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2002  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 504 aa  1014    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0542145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  31.96 
 
 		 466 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.24 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  28.66 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.49 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.86 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  33.78 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.48 
 
 		 470 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.48 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.07 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.28 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.28 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.08 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.08 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.28 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.33 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.92 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  30.44 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.08 
 
 		 470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.72 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  31.04 
 
 		 499 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.41 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.23 
 
 		 495 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  31.11 
 
 		 499 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  31.11 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  30.58 
 
 		 499 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.51 
 
 		 459 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  28.99 
 
 		 499 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  29.5 
 
 		 499 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  29.6 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  29.6 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.37 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  30.89 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  29.37 
 
 		 499 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  29.15 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  28.31 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.5 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  27.74 
 
 		 492 aa  158  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  29.15 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  29.05 
 
 		 496 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  28.95 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  28.7 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.13 
 
 		 476 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  26.43 
 
 		 470 aa  156  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.98 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  30.18 
 
 		 499 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  29.08 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.95 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  29.02 
 
 		 499 aa  153  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.21 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  28.54 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  29.08 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  29.18 
 
 		 475 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.01 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  29.66 
 
 		 499 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  27.39 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.8 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  30.75 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  29.64 
 
 		 479 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.29 
 
 		 492 aa  149  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.89 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  27.44 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.89 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  26.45 
 
 		 461 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.02 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.38 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.17 
 
 		 466 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  29.18 
 
 		 498 aa  146  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.97 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.19 
 
 		 890 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  30.11 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  28.83 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.13 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  29.21 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 		 503 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.76 
 
 		 494 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.57 
 
 		 464 aa  143  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.31 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.23 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.4 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.16 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  29.07 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  26.83 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.64 
 
 		 496 aa  141  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  26.12 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  27.52 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>