More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3694 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3694  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
474 aa  932    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2803  general substrate transporter  41.59 
 
 
432 aa  300  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1770  major facilitator superfamily protein  40.43 
 
 
433 aa  286  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3606  alpha-ketoglutarate permease  39.86 
 
 
434 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  38.48 
 
 
436 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
433 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 
443 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  39.84 
 
 
436 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4459  citrate-proton symport  35.51 
 
 
439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  37.38 
 
 
436 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1041  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.55 
 
 
471 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356945  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4323  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.65 
 
 
439 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0407657  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1400  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.41 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  36.5 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.35 
 
 
436 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4411  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.17 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0868  alpha-ketoglutarate permease  32.57 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0921  alpha-ketoglutarate permease  32.57 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0836  major facilitator superfamily sugar transporter  32.72 
 
 
441 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3777  general substrate transporter  35.01 
 
 
430 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4347  putative alpha-ketoglutarate permease  32.49 
 
 
440 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0300225  hitchhiker  5.49255e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1649  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
425 aa  252  8.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1003  alpha-ketoglutarate permease  32.95 
 
 
441 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
443 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1008  alpha-ketoglutarate permease, putative  32.27 
 
 
440 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0964  putative alpha-ketoglutarate permease  32.27 
 
 
440 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668227  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7129  major facilitator transporter  36.14 
 
 
435 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1088  putative alpha-ketoglutarate permease  32.57 
 
 
440 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3999  major facilitator transporter  34.54 
 
 
441 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321755  normal  0.07959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72960  putative MFS dicarboxylate transporter  33.49 
 
 
435 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.633358  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0810  general substrate transporter  32.04 
 
 
440 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4296  metabolite-proton symporter, putative  34.25 
 
 
441 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6332  putative MFS dicarboxylate transporter  33.64 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  36.67 
 
 
445 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0793  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
434 aa  243  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  37.5 
 
 
452 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.96 
 
 
452 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  35.66 
 
 
434 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3486  General substrate transporter  34.18 
 
 
439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3434  General substrate transporter  34.38 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0205  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.14 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0261779  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3900  General substrate transporter  34.91 
 
 
448 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148147  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3787  General substrate transporter  34.91 
 
 
448 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536994  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.76 
 
 
430 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  35.98 
 
 
438 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  36.22 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.17 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2266  MFS permease  33.73 
 
 
439 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2876  alpha-ketoglutarate permease  33.18 
 
 
440 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  0.0424251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 
438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  35.66 
 
 
442 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2955  general substrate transporter  35.9 
 
 
444 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00217924  normal  0.0672974 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  34.68 
 
 
425 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4675  general substrate transporter  36.68 
 
 
432 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0145765  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 
438 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0007  putative alpha-ketoglutarate permease transmembrane protein  33.49 
 
 
447 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  36.9 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  35.81 
 
 
458 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  34.91 
 
 
440 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  36.41 
 
 
445 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  36.12 
 
 
440 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  35.89 
 
 
433 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0083  alpha-ketoglutarate permease  31.99 
 
 
450 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0743479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0069  alpha-ketoglutarate permease  31.99 
 
 
450 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000322266  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1571  alpha-ketoglutarate permease  31.99 
 
 
634 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1508  alpha-ketoglutarate permease  31.99 
 
 
450 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000476887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0081  alpha-ketoglutarate permease  31.99 
 
 
450 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0100  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  31.99 
 
 
450 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000762356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  35.29 
 
 
425 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1958  general substrate transporter  33.26 
 
 
441 aa  230  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  36.43 
 
 
445 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  35.29 
 
 
425 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  35.29 
 
 
425 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.94 
 
 
437 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  34.02 
 
 
441 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  33.33 
 
 
449 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  34.04 
 
 
439 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.16 
 
 
442 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  35.29 
 
 
425 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  34.68 
 
 
552 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  35.2 
 
 
431 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1720  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.88 
 
 
445 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.317591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  33.64 
 
 
439 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  34.55 
 
 
503 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  35.95 
 
 
445 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  33.58 
 
 
438 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  34.05 
 
 
467 aa  226  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
457 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
435 aa  226  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  35.1 
 
 
425 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  34.78 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  34.7 
 
 
531 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4939  General substrate transporter  33.33 
 
 
493 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506822  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1453  metabolite-proton symporter  33.03 
 
 
441 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  35.58 
 
 
436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  36.94 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.09 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  34.32 
 
 
495 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  33.41 
 
 
444 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>