More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0518 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  54.14 
 
 		 1118 aa  711    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  55.44 
 
 		 1026 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  55.32 
 
 		 1026 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  57.47 
 
 		 1047 aa  745    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0800  error-prone DNA polymerase  55.12 
 
 		 1075 aa  707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.338798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4261  DNA polymerase III, alpha subunit  53.06 
 
 		 1128 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172796 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1063 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  59.04 
 
 		 1049 aa  792    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  54.52 
 
 		 1026 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  53.82 
 
 		 1031 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  53.38 
 
 		 1109 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1063 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  73.92 
 
 		 1041 aa  983    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  54.07 
 
 		 1031 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  56.9 
 
 		 1027 aa  730    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  69.3 
 
 		 1044 aa  917    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4523  error-prone DNA polymerase  53.17 
 
 		 1111 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  63.02 
 
 		 1023 aa  793    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1072 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4621  error-prone DNA polymerase  55.87 
 
 		 1079 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743632  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  54.7 
 
 		 1025 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  56.18 
 
 		 1044 aa  702    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  54.32 
 
 		 1068 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1063 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  73.47 
 
 		 1033 aa  989    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  53.85 
 
 		 1071 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  54.88 
 
 		 1071 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  56.97 
 
 		 1076 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  60.63 
 
 		 1040 aa  803    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0518  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 668 aa  1368    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  55.18 
 
 		 1071 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  55.39 
 
 		 1084 aa  732    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  56.08 
 
 		 1064 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  61.45 
 
 		 1049 aa  818    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  53.05 
 
 		 1015 aa  674    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  60.27 
 
 		 1084 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  50.15 
 
 		 1029 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  55.32 
 
 		 1026 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  56.69 
 
 		 1068 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3164  DNA polymerase III, alpha subunit  53.37 
 
 		 1195 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  53.05 
 
 		 1020 aa  674    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  56.78 
 
 		 1061 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1095  DNA polymerase III, alpha subunit  56.03 
 
 		 1044 aa  695    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  54.14 
 
 		 1071 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02092  error-prone DNA polymerase  51.69 
 
 		 1083 aa  649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  59.19 
 
 		 1049 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  55.38 
 
 		 1024 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  53.16 
 
 		 1036 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1948  DNA polymerase III, alpha subunit  52.44 
 
 		 1075 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  56.31 
 
 		 1025 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  55.17 
 
 		 1099 aa  693    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1384  DNA polymerase III, alpha subunit  53.1 
 
 		 1193 aa  735    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.38254  hitchhiker  0.00082485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  55.9 
 
 		 1026 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  54.73 
 
 		 1071 aa  718    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1072 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  57.23 
 
 		 1031 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  54.14 
 
 		 1071 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  60.57 
 
 		 1043 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6832  DNA polymerase III, alpha subunit  59.22 
 
 		 961 aa  811    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.905572  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  58.73 
 
 		 1049 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1063 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  53.14 
 
 		 1026 aa  661    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  55.87 
 
 		 1079 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  55.69 
 
 		 1072 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1863  DNA-directed DNA polymerase  50.91 
 
 		 1030 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0330088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4536  DNA polymerase III, alpha subunit  74.35 
 
 		 1040 aa  1009    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  53.96 
 
 		 1039 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4130  error-prone DNA polymerase  53.59 
 
 		 1153 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003014  DNA polymerase III alpha subunit  49 
 
 		 1024 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  48.77 
 
 		 1085 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02868  DNA polymerase III alpha chain  48.85 
 
 		 1024 aa  611  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  50.07 
 
 		 1077 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  50.69 
 
 		 1093 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  48.88 
 
 		 1077 aa  595  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  47.1 
 
 		 1045 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  46.78 
 
 		 1074 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  47.83 
 
 		 1110 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3563  error-prone DNA polymerase  46.7 
 
 		 1165 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.863163  normal  0.552046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  48.58 
 
 		 1112 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2666  error-prone DNA polymerase  48.14 
 
 		 1164 aa  588  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  48.7 
 
 		 1145 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  45.99 
 
 		 1055 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  48.25 
 
 		 1053 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  49.23 
 
 		 1082 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  47.92 
 
 		 1074 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  49.09 
 
 		 1096 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  48.42 
 
 		 1090 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  45.08 
 
 		 1076 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  48.63 
 
 		 1059 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2255  error-prone DNA polymerase  47.09 
 
 		 1175 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1123  DNA polymerase III, alpha subunit  48.49 
 
 		 940 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2785  DNA polymerase III, alpha subunit  48.64 
 
 		 940 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3468  DNA polymerase III, alpha subunit  47.97 
 
 		 1116 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.822294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  47.7 
 
 		 1087 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4461  DNA polymerase III, alpha subunit  47.06 
 
 		 1117 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  48.17 
 
 		 1059 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00038  putative DNA polymerase III alpha chain  48.37 
 
 		 986 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0102  DNA polymerase III, alpha subunit  46.14 
 
 		 994 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2987  error-prone DNA polymerase  47.02 
 
 		 1196 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  46.66 
 
 		 1116 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>